Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 LSM8-201ENST00000249299 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 RPL6P8-201ENST00000490136 843 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AP001505.1-201ENST00000569966 824 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.58-201ENST00000618720 282 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC021231.1-201ENST00000559246 1342 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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