Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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SCGB2A2Q13296 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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SCGB2A2Q13296 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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SCGB2A2Q13296 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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SCGB2A2Q13296 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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SCGB2A2Q13296 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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SCGB2A2Q13296 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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SCGB2A2Q13296 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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