Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms