Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms