Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms