Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms