Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms