Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms