Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RPS29P62273 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms