Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSCP56915 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSCP56915 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSCP56915 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSCP56915 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSCP56915 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSCP56915 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSCP56915 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSCP56915 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSCP56915 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSCP56915 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSCP56915 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSCP56915 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSCP56915 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSCP56915 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSCP56915 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSCP56915 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSCP56915 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSCP56915 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSCP56915 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSCP56915 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSCP56915 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSCP56915 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms