Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms