Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRXP46100 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATRXP46100 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATRXP46100 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATRXP46100 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATRXP46100 S100A7A-202ENST00000368728 440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATRXP46100 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATRXP46100 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATRXP46100 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
ATRXP46100 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
ATRXP46100 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATRXP46100 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATRXP46100 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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