Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms