Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms