Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP1P29466 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP1P29466 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP1P29466 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP1P29466 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms