Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms