Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2AP24928 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms