Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms