Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AMD1P17707 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AMD1P17707 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AMD1P17707 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AMD1P17707 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AMD1P17707 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AMD1P17707 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AMD1P17707 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AMD1P17707 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AMD1P17707 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AMD1P17707 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AMD1P17707 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AMD1P17707 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AMD1P17707 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AMD1P17707 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AMD1P17707 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AMD1P17707 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AMD1P17707 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AMD1P17707 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AMD1P17707 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AMD1P17707 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
AMD1P17707 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms