Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms