Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms