Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM228BP0C875 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms