Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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