Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC28A2O43868 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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