Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSM2O43147 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms