Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCHNA4D1U4 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms