Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms