Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms