Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms