Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ARHGEF38Q9NXL2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ARHGEF38Q9NXL2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ARHGEF38Q9NXL2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ARHGEF38Q9NXL2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ARHGEF38Q9NXL2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGEF38Q9NXL2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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