Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TBCCD1Q9NVR7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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