Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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