Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FANCFQ9NPI8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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