Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms