Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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