Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms