Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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