Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YME1L1Q96TA2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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