Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms