Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms