Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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