Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms