Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms