Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP4Q86YS3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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