Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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LINC00299Q6ZSB3 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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LINC00299Q6ZSB3 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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LINC00299Q6ZSB3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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LINC00299Q6ZSB3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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LINC00299Q6ZSB3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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LINC00299Q6ZSB3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00299Q6ZSB3 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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