Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 IL36RN-202ENST00000393200 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AL512274.1-201ENST00000562471 2027 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 IFFO1-205ENST00000436152 3101 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms