Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEK5Q6P3R8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEK5Q6P3R8 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEK5Q6P3R8 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEK5Q6P3R8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEK5Q6P3R8 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms