Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KHDC3LQ587J8 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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