Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms