Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms